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基因芯片技术服务
双击自动滚屏 发布者:admin 发布时间: 阅读:4332

基因芯片技术服务

主要功能

1. 基因芯片技术服务能够完成小鼠和人类基因表达谱芯片的优化和批量制作。
2.
通过对基因芯片数据处理和分析,可对芯片数据进行倍值,统计,聚类,分子网络等系列分析。
3.
通过设计TaqMan探针和引物可提供对芯片结果的定量实时PCR(TaqMan)验证支持。
4.
提供对小鼠和人类表达谱芯片所有基因的生物信息学自动注释及更新。

实验仪器

1. OmniGrid100 Microarrayer
       
主要特点与技术参数
        ·
高速可靠的马达和和移动平台精确性:两次重复<+-2.5um
        ·
步进精度:2.5um(X轴和Y):1.25um(Z)
        ·
配的是Telechem,点的平均大小约150um
        ·
一次最多可放置100块标准玻片,每片现在最多可点22000个点

2. Genepix4000B Scanner(Axon)
       
主要特点与技术参数
        ·
是基于PMT(photomultiplier tube, 光电倍增管)的检测系统的激光共聚焦原理。
        ·
可以选择同步或是连续扫描,同步扫描可以避免由于机械原因造成的玻片的定位不准确,扫描误差的出现。
        ·
为单玻片手动载入,具有635nm(红色的)532nm(绿色的)两色激光以及适配的红色和绿色的发射滤光片。
        ·
它可扫描多种材料,扫描大小为25mm×75mm
        ·
激光强度由5-100%连续可调。
        ·
扫描精度可从5μm-10μm分级调整

人和小鼠的cDNA表达谱芯片基本分类信息

人的cDNA表达谱芯片基本分类信息

小鼠的cDNA表达谱芯片基本分类信息

Biological Process

gene number

Biological Process

gene number

Amino acid metabolism

44

Cell juction protein

23

Apoptosis

237

Chaperone

17

Carbohydrate metabolism

132

Cytoskeletal protein

37

Cell adhesion

274

Extracellular matrix

20

Cell cycle

425

Hydrolase

460

Cell proliferation and differentiation

283

Ion channel

62

Cell structure and motility

79

Isomerase

52

Coenzyme and prosthetic group metabolism

3

Kinase

421

Developmental processes

750

Lyase

68

Electron transport

200

Nucleic acid binding

444

Homeostasis

44

Oxidoreductase

334

Intracellular protein traffic

62

Phosphatase

32

Lipid, fatty acid and steroid metabolism

183

Protease

8

Muscle contraction

68

Receptor

447

Neuronal activities

62

Signaling molecule

156

Nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism

246

Synthase and synthetase

51

Phosphate metabolism

25

Transcription factor

307

Protein metabolism and modification

227

Transferase

496

Protein targeting and localization

18

Transporter

231

Signal transduction

1065

 

 

Transport

1019

 

 

 

服务内容

服务名称

服务内容

定制芯片

根据顾客需要设计和制备cDNA芯片

芯片实验设计

为顾客设计优化芯片实验以利于得到可靠的数据和成果发表

RNA样品制备

从细胞或组织中提取RNA样品

样本标记和杂交

1. RNAcDNAcRNA,单荧光标记,与CodelinkAffymetrix oligo芯片杂交
2. RNA
cDNACy3Cy5标记,与cDNA芯片杂交

芯片简单数据处理 

1. 芯片所含基因的GeneBank号、基因名称与功能简单描述
2.
芯片实验检测得到的信号值
3.
数据分析后的信号比值,排序,筛选表达显著性改变的基因
4.
芯片荧光信号彩色图谱一张

芯片数据系列分析

统计分析,聚类分析(Hierarchical Clustering)组图分析(Self_Organizing Maps, SOMs)分子网络(pathway analysis)

芯片技术服务内容说明
1. 费用:对于材料费(芯片费用)我们将给予优惠的价格;由于我们与CodelinkAffymetrix公司有着很好的战略伙伴关系,我们愿意全力协助广大的科研人员并以最优惠的价格提供服务。详细服务价格敬请来电查询。(也可以自行提供.)
2. RNA
样本要求:a) cDNA芯片,每张芯片需提供30µg-60µg total RNAb) CodelinkAffymetrix的寡核苷酸芯片,每张芯片需提供5ug-15µg total RNA
3.
时间:服务所需时间依样本情况而定,一般情况下,当我们收到您所提供的达到要求的样本后2周后即可交付结果。

 

 

 

服务价格

服务内容

服务收费

芯片制作

 

开机费

2500元(6小时内),每小时加收250

玻璃片

150/

384-well plate

 250/plate

点样

4/

样品固定

180/

转移样品

600/384-well

芯片点样位置设计

1000  350/

1001-5000点,550/

5000点,850/

核酸提取及荧光标记

视具体实验内容收费

杂交反应

视具体实验内容收费

Axon Scanner图象扫描

600/张芯片

Genepix定量分析

1000点,550/张芯片

1001-5000点,850/张芯片

5000点,1200/张芯片

基因表达的Real-time RT-PCR验证

 

引物设计、RNA逆转录、Real-time RT-PCR及数据分析

视具体实验内容收费

基因芯片数据分析

数据质量评估

180/

基本数据分析(杂交信号值、基因注释、信号比值、差异表达基因的筛选)

前两张:¥3500/张,
多于两张则以后¥600/

高级数据分析服务(基本数据分析、统计分析、筛选差异表达基因、表达模式识别、功能富集分析、文献挖掘等)

6000/

 
 

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